Ini adalah perintah fuzztrane yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
fuzztran - Mencari pola dalam urutan protein (diterjemahkan)
RINGKASAN
fuzztran -urutan seqall -pola belt hold [-bingkai daftar] [-meja daftar] -file keluar melaporkan
fuzztran -bantu
DESKRIPSI
fuzztran adalah program baris perintah dari EMBOSS (“European Molecular Biology Open
Paket Perangkat Lunak"). Ini adalah bagian dari grup perintah "Nucleic:Motifs,Protein:Motifs".
PILIHAN
Memasukkan bagian
-urutan seqall
-pola belt hold
Kode satu huruf IUPAC standar untuk asam amino digunakan. Simbol 'x' adalah
digunakan untuk posisi di mana setiap asam amino diterima. Ambiguitas ditunjukkan oleh
daftar asam amino yang dapat diterima untuk posisi tertentu, di antara tanda kurung siku '[
]'. Misalnya: [ALT] singkatan dari Ala atau Leu atau Thr. Ambiguitas juga ditunjukkan oleh
daftar antara sepasang kurung kurawal '{}' asam amino yang tidak diterima
pada posisi tertentu. Misalnya: {AM} singkatan dari asam amino apa pun kecuali Ala dan Met.
Setiap elemen dalam suatu pola dipisahkan dari tetangganya dengan tanda '-'. (Opsional dalam
fuzztran) Pengulangan elemen pola dapat ditunjukkan dengan mengikuti:
elemen dengan nilai numerik atau rentang numerik antara tanda kurung. Contoh:
x(3) sesuai dengan xxx, x(2,4) sesuai dengan xx atau xxx atau xxxx. Ketika sebuah
pola dibatasi untuk terminal N- atau C dari suatu urutan, pola itu
baik dimulai dengan simbol '<' atau masing-masing diakhiri dengan simbol '>'. Sebuah periode berakhir
pola. (Opsional di fuzztran). Misalnya, [DE](2)HS{P}X(2)PX(2,4)C
Tambahan bagian
-bingkai daftar
Nilai default: 1
-meja daftar
Keluaran bagian
-file keluar melaporkan
Gunakan fuzztrane online menggunakan layanan onworks.net
