bawang putih - Online di Cloud

PROGRAM:

NAMA

bawang putih - program visualisasi molekuler

RINGKASAN

bawang putih [benar Bawang putih Pilihan] [X11 Pilihan] [nama file]

DESKRIPSI

Halaman manual ini secara singkat mendokumentasikan bawang putih, program visualisasi molekul gratis.
Dokumentasi ekstensif dalam format dan sumber HTML dapat ditemukan di rumah bawang putih,
<URL:http://garlic.mefos.hr/garlic/>. Lokasi fisik: Fakultas Kedokteran, Universitas
dari Osijek, Kroasia, Eropa. Paket yang telah dikompilasi untuk sejumlah distribusi GNU/Linux
tersedia. Ini termasuk Debian, SuSE, Mandriva, Linspire dan sejumlah lainnya
distro. Dokumentasi HTML dapat diunduh dan dibongkar untuk penggunaan lokal (disarankan
penggunaan). Di sini Anda dapat menemukan deskripsi yang sangat singkat tentang program dan daftar perintah
pilihan baris.

bawang putih adalah program visualisasi molekul yang awalnya ditulis untuk penyelidikan
protein membran. Sekarang ini dapat digunakan untuk memvisualisasikan dan mengedit sederhana semua protein dan
molekul. Versi ini mengenali format PDB versi 2.1; lihat file sumbernya pdb_atom.c
untuk detail tentang format ini.

PILIHAN

Opsi baris perintah dapat dibagi menjadi dua kelompok: benar (spesifik) bawang putih Pilihan dan X11
Pilihan. Opsi dapat diberikan dalam urutan apa pun. Semua opsi dan nilai default hard-coded adalah
tercantum dalam tabel di bawah ini. Untuk setiap parameter, nilai yang ditentukan melalui baris perintah adalah
digunakan, jika tersedia. Jika tidak, nilai yang didefinisikan dalam .garlicrc berkas digunakan. Jika .garlicrc
file tidak tersedia, atau tidak ada entri yang sesuai dalam file ini, hard-coded
nilai default digunakan. Contoh .garlicrc file yang termasuk dalam paket asli berisi
nilai yang sama dengan default hard-coded.

bawang putih pilihan:
-H, --membantu
Cetak bantuan dan keluar.

-di, --Versi: kapan
Versi cetak dan keluar.

-R, --daftar
Daftarkan bawang putih: beri tahu penulis bahwa situs Anda telah menginstal bawang putih dan seseorang itu
akan menggunakan program ini. Dengan mendaftar, Anda mendorong penulis untuk
melanjutkan pengembangan bawang putih. Anda juga dapat membantu penulis untuk memastikan dukungan untuk
pengembangan lebih lanjut. Opsi ini mengirim satu pesan email singkat, yang hanya berisi
header pesan email dan kata 'Hai!',untuk[email dilindungi]>. Tolong
jalankan bawang putih -r jika Anda akan menggunakan program ini. Jika Anda tidak terhubung ke
Internet, pertimbangkan untuk mengirim pesan singkat dari beberapa sistem lain.

-usil Sembunyikan ikon sistem koordinat (pojok kiri atas).

-tanpa kendali
Sembunyikan jendela kontrol (pojok kanan atas).

-stereo
Menampilkan gambar stereo.

-lempeng mode
Mode pelat standar. Mode slab yang tersedia adalah: mati, planar (default), bola,
setengah bola, silinder dan setengah silinder.

-kabur mode
Mode pemudaran warna default. Mode yang tersedia: mati, planar (default), bola,
setengah bola, silinder dan setengah silinder.

-sebagai jumlah
Gaya gambar atom default (standar hard-coded: 2).

-b jumlah
Gaya gambar ikatan default (default hard-coded: 2).

-fs jumlah
Jumlah default permukaan memudar warna. Bidang sejajar, bola konsentris atau
silinder konsentris dapat digunakan sebagai permukaan fading. Tiga kembar tiga RGB adalah
ditugaskan untuk setiap permukaan. Permukaan ditempatkan secara merata; setidaknya satu dan paling banyak
delapan harus ditentukan. Setidaknya tiga warna (kiri, tengah dan kanan) adalah
ditugaskan untuk setiap atom yang terlihat. Ketiga warna ini didasarkan pada posisi a
atom yang diberikan relatif terhadap permukaan fading terdekat dan pada warna yang ditetapkan untuk
permukaan ini. Warna digabungkan menggunakan pembobotan linier.

-lc warna
Warna kiri pada permukaan ke-i; i antara nol dan tujuh. Tali warna
harus sesuai dengan X11R5. Biru, misalnya, dapat didefinisikan sebagai biru atau sebagai
RGB:0000/0000/FFFF dll. Misalnya -lc4 RGB:BBBB/8888/4444 mendefinisikan warna kiri
pada permukaan yang indeksnya sama dengan empat.

-mc warna
Warna tengah pada permukaan ke-i.

-rc warna
Warna yang tepat pada permukaan ke-i.

-buah, --cetak-config
Cetak data konfigurasi dan keluar.

-pcn Cetak nama kursor ke stdout dan keluar.

-catatan file log
Tulis perintah dan pesan ke file log. File akan dibuat di saat ini
direktori kerja. Jika ini tidak memungkinkan, file log akan dibuat di beranda pengguna
direktori.

X11 opsi:
-tampilan nama tampilan
Server X untuk dihubungi.

-geometri geom
Geometri jendela (default: hampir seluruh layar).

-bg warna
Warna latar belakang jendela utama (default adalah hitam).

-fg warna
Warna latar depan jendela utama (default: putih).

-fn nama font
Fon teks; (standarnya adalah 10x20).

-tbg warna
Warna latar belakang teks (default adalah hitam).

-tfg warna
Warna teks (default adalah putih).

-kursor nama kursor
nama kursor; Lihat /usr/include/X11/cursorfont.h untuk nama; hapus awalan XC_.

Gunakan bawang putih online menggunakan layanan onworks.net