Ini adalah perintah gt-chseqids yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
gt-chseqids - Ubah id urutan dengan pemetaan yang diberikan dalam file pemetaan.
RINGKASAN
gt chseqid [opsi ...] mapping_file [GFF3_file]
DESKRIPSI
-menyortir [ya|tidak]
mengurutkan fitur GFF3 setelah mengubah id urutan (konsumsi memori adalah
sebanding dengan ukuran file input) (default: tidak)
-v [ya|tidak]
bertele-tele (default: tidak)
-o [nama file]
redirect output ke file yang ditentukan (default: undefined)
-gzip [ya|tidak]
tulis file keluaran terkompresi gzip (default: tidak)
-bzip2 [ya|tidak]
tulis file output terkompresi bzip2 (default: tidak)
-memaksa [ya|tidak]
paksa menulis ke file keluaran (default: tidak)
-bantu
tampilkan bantuan dan keluar
-versi
tampilkan informasi versi dan keluar
Format file untuk mapping_file:
File pemetaan yang disediakan mendefinisikan tabel pemetaan bernama "chseqids". Ini memetakan
entri sequence-region yang diberikan dalam GFF3_file ke nama lain. Ini dapat didefinisikan sebagai
berikut:
chseqids = {
chr1 = "seq1",
chr2 = "seq2"
}
Ketika contoh ini digunakan, semua id urutan "chr1" akan diubah menjadi "seq1" dan semua
urutan id "chr2" ke "seq2".
PELAPORAN BUG
Laporkan bug ke[email dilindungi]>.
Gunakan gt-chseqids online menggunakan layanan onworks.net
