Ini adalah perintah kmc_tools-intersect yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
kmc_tools-intersect - menghitung perpotongan dua basis data KMC
RINGKASAN
kmc_tools memotong <output
[output_params]>
DESKRIPSI
Basis data keluaran hanya akan berisi k-mer yang ada di kedua set masukan. NS
nilai counter dalam database output sama dengan nilai counter yang lebih rendah di input.
PILIHAN
Untuk setiap input ada parameter tambahan:
-ci
mengecualikan k-mers yang terjadi kurang dari waktu
-cx
mengecualikan k-mers yang muncul lebih dari waktu
Untuk output ada parameter tambahan:
-ci
mengecualikan k-mers yang terjadi kurang dari waktu
-cx
mengecualikan k-mers yang muncul lebih dari waktu
-cs
nilai maksimal penghitung
CONTOH
kmc -k28 file1.fastq kmers1 tmp
kmc -k28 file2.fastq kmers2 tmp
kmc_tools berpotongan kmers1 -ci10 -cx200 kmers2 -ci4 -cx100 kmers1_kmers2_intersect -ci20 -cx150
Gunakan kmc_tools-intersect online menggunakan layanan onworks.net
