Ini adalah perintah pregap4 yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
pregap4 - menyiapkan data mentah dari instrumen pengurutan untuk digunakan dengan gap4 (bagian dari staden
paket)
DESKRIPSI
Sebelum masuk ke database gap4, data mentah dari instrumen pengurutan perlu
melewati beberapa proses, seperti penyaringan untuk vektor, evaluasi kualitas, dan
konversi format data. Pregap4 digunakan untuk melewatkan sekumpulan pembacaan melalui ini
langkah secara otomatis. Ini menyediakan antarmuka untuk mengatur dan mengonfigurasi
pengolahan dan untuk mengendalikan bagian dari bacaan melalui setiap tahap. NS
tugas terpisah disebut "modul" dan setiap modul biasanya dikelola oleh
program. Pregap4 membungkus semua modul ini menjadi satu lingkungan yang mudah digunakan, sementara
mempertahankan fleksibilitas untuk memilih dan memperluas modul pemrosesan. Ini adalah, sebagai
namun, penggantian program pregap yang tidak dipublikasikan Bonfield, JK dan Staden, R.
File eksperimen dan aplikasinya selama proyek pengurutan skala besar. DNA
Urutan 6, 109-117 (1996).
Gunakan pregap4 online menggunakan layanan onworks.net
