Ini adalah perintah primer3_core yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
primer3_core - Mendesain primer untuk PCR
RINGKASAN
primer3_core [-format_output] [-strict_tags] [ masukan_file]
DESKRIPSI
primer3_core mengambil primer untuk reaksi PCR, dengan mempertimbangkan kriteria oligonukleotida
suhu leleh, ukuran, konten GC dan kemungkinan primer-dimer, ukuran produk PCR,
kendala posisi dalam urutan sumber, dan kendala lain-lain lainnya.
Secara default, primer3_core menerima input dan menghasilkan output dalam format Boulder-io, pra-XML
format input/output berbasis teks untuk format pertukaran data program-ke-program. NS
Format Boulder-io dan perintah yang dipahami primer3_core dijelaskan dalam
README file, yang pada sistem Debian dapat ditemukan di /usr/share/doc/primer3/.
PILIHAN
-format_keluaran
Mencetak laporan yang lebih berorientasi pengguna untuk setiap urutan.
-ketat_tag
primer3_core menggema dan mengabaikan tag apa pun yang tidak dikenalinya, kecuali
-ketat_tag flag diatur pada baris perintah, dalam hal ini primer3_core mencetak
kesalahan dalam tag keluaran PRIMER_ERROR, dan mencetak informasi tambahan pada stdout;
opsi ini dapat berguna untuk men-debug sistem yang menggabungkan primer.
Note
Bendera lama -2x_compat tidak lagi didukung.
EXIT STATUS KODE
· 0 pada operasi normal.
· -1 dalam kondisi berikut: argumen baris perintah ilegal, tidak dapat di-flush
stdout, tidak dapat membuka (untuk menulis dan membuat) file .for, .rev atau .int (mungkin
karena masalah perlindungan).
· -2 kehabisan memori.
· -3 masukan kosong.
· -4 kesalahan dalam tag input "Global" (pesan dalam PRIMER_ERROR).
REFERENSI
Silakan kutip Rozen, S., Skaletsky, H. "Primer3 di WWW untuk pengguna umum dan untuk
programmer biologi." Dalam S. Krawetz dan S. Misener, eds. Bioinformatics Methods and
Protokol dalam seri Metode dalam Biologi Molekuler. Humana Press, Totowa, NJ, 2000,
halaman 365-386.
Gunakan primer3_core online menggunakan layanan onworks.net
