Ini adalah aplikasi Linux bernama BamBam yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai bambam-1.4.tgz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama BamBam ini dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
BamBam
Ad
DESKRIPSI
BamBam mencakup banyak alat untuk menganalisis data sekuensing DNA generasi berikutnya. Alat disediakan untuk memanggil SNP dan indel, mengidentifikasi penghapusan skala besar, menghitung jumlah pembacaan yang dipetakan, analisis metilasi, dan banyak lagi.
Tergantung pada SAMtools (http://samtools.sourceforge.net/) dan BAMtools (https://github.com/pezmaster31/bamtools). Juga menggunakan BioPerl, yang termasuk dalam tarball unduhan.
Fitur
- panggil SNP dan indel
- menghubungkan genotipe
- membangun urutan konsensus
- tabulasi jumlah bacaan yang dipetakan (RNA-seq)
- menyimpulkan pentahapan haplotipe dengan pengelompokan K-means
- menganalisis metilasi DNA (bisulfit-sequencing)
Para penonton
Sains/Penelitian
Bahasa Pemrograman
Perl, C++
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/bambam/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.