Ini adalah aplikasi Linux bernama BLAST Ring Image Generator yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai BRIG-0.95-dist.zip. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan aplikasi ini secara online bernama BLAST Ring Image Generator dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
Generator Gambar Cincin BLAST
DESKRIPSI
BRIG adalah aplikasi lintas platform (Windows/Mac/Unix) yang dapat menampilkan perbandingan melingkar antara sejumlah besar genom, dengan fokus pada penanganan data perakitan genom.Silakan kutip makalah BRIG jika BRIG digunakan untuk menghasilkan angka untuk publikasi: NF Alikhan, NK Petty, NL Ben Zakour, SA Beatson (2011) BLAST Ring Image Generator (BRIG): perbandingan genom prokariota sederhana, BMC Genomics, 12:402. PMID: 21824423
Fitur
- Gambar menunjukkan kesamaan antara urutan referensi pusat dan urutan lainnya sebagai cincin konsentris.
- BRIG akan melakukan semua perbandingan BLAST dan penguraian file secara otomatis melalui GUI sederhana.
- Batas contig dan cakupan baca dapat ditampilkan untuk draf genom; grafik dan anotasi yang disesuaikan dapat ditampilkan.
- Menggunakan set gen yang ditentukan pengguna sebagai input, BRIG dapat menampilkan keberadaan gen, ketidakhadiran, pemotongan atau variasi urutan dalam satu set genom lengkap, genom draft atau bahkan data urutan mentah yang belum dirakit.
- BRIG juga menerima file read-mapping berformat SAM yang memungkinkan wilayah genomik yang ada dalam data urutan yang belum dirakit dari beberapa sampel untuk dibandingkan secara bersamaan
Para penonton
Sains/Penelitian
Bahasa Pemrograman
Jawa
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/brig/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
