Ini adalah aplikasi Linux bernama Hierachical_DNAcoder yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai Sourcecode.zip. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan aplikasi ini secara online bernama Hierachical_DNAcoder dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
Hierachical_DNAcoder
DESKRIPSI
Penyimpanan dan transfer data dari data genom besar menjadi perhatian penting bagi para peneliti biomedis. Kami menyajikan metode kompresi genom berbasis multi-referensi baru dengan struktur hierarkis. Pendekatan kami bekerja untuk format penyelarasan standar de facto (yaitu, BAM) kompresi yang merupakan kebutuhan mendesak saat ini. Kami menyelaraskan urutan baru ke urutan referensi menggunakan SOAP3, perangkat lunak penyelarasan berbasis GPU, dan meringkas properti pemetaan dan informasi untuk pembacaan yang dipetakan dengan tepat. Untuk meningkatkan tingkat penyelarasan yang tepat, kami juga menyelaraskan kembali bacaan yang kira-kira dipetakan dan tidak dipetakan dengan mengubah urutan referensi atau memperpendek panjang bacaan. Sementara itu, kami melanjutkan studi menggunakan nilai kualitas "lossy" melalui skema pengelompokan k-means dan menemukan efek menitnya pada aplikasi hilir. Metode yang diusulkan telah mencapai rasio kompresi 0.5-0.65, yang sesuai dengan penghematan ruang 35%-50%, pada dataset eksperimental.
Fitur
- Efisien
- Cepat
- Menjanjikan
Para penonton
Teknologi Informasi, Sains/Penelitian, Teknik
Bahasa Pemrograman
C + +
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/hierachicaldnac/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
