Ini adalah aplikasi Linux bernama miRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) untuk dijalankan di Linux online yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai mirnaTA_v1.2.3.tar.gz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan online aplikasi ini bernama miRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) untuk dijalankan di Linux online dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
miRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) untuk dijalankan di Linux online
DESKRIPSI
MicroRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) adalah alat bioinformatika yang dapat digunakan untuk mengidentifikasi miRNA yang diekspresikan secara berbeda dalam studi temporal. Ini diimplementasikan dalam paket Perl dan R (>= 2.13.0) dan dapat dijalankan di berbagai platform seperti Linux, Mac dan Windows. MirnaTA mengharuskan pengguna memberikan data dari minimal dua titik waktu dan menganalisis hingga 20 titik waktu. Untuk menormalkan data dan menghilangkan variabilitas teknis, Transformasi Kuantil Normal (NQT) digunakan, dan data yang dinormalisasi dianalisis menggunakan model regresi linier untuk menemukan miRNA yang diekspresikan secara berbeda secara linier. Setiap miRNA dengan nilai P<0.05 dianggap signifikan secara statistik. Sisa miRNA yang tidak cocok dalam model linier dianalisis lebih lanjut dalam dua metode yang berbeda: (1) jika jumlah titik waktu <3, CDF dari distribusi normal, dan (2) jika jumlah titik waktu >= 3, ANOVA digunakan.http://www.gigasciencejournal.com/content/3/1/20
Fitur
- Penganalisis Temporal miRNA
- Transformasi Kuantil Normal (NQT)
- hingga 20 poin waktu
- Paket R.
- Perl
- heatmap
- mudah dijalankan
- antarmuka HTML grafis
- keluaran sederhana
Para penonton
Sains/Penelitian
Bahasa Pemrograman
Perl
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/mirnata/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
