Ini adalah aplikasi Linux bernama ParDRe yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai ParDRe-rel2.2.5.tar.gz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama ParDRe dengan OnWorks ini secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
ParDRe
Ad
DESKRIPSI
ParDRe adalah alat paralel untuk menghapus pembacaan duplikat. Bacaan duplikat dapat dilihat sebagai identik
atau urutan yang hampir identik dengan beberapa ketidakcocokan. Alat ini akan memungkinkan pengguna untuk menghindari analisis pembacaan yang tidak perlu, mengurangi waktu prosedur selanjutnya dengan kumpulan data (misalnya, rakitan, pemetaan, dll.).
Alat ini diimplementasikan dengan MPI untuk mengeksploitasi kemampuan paralel multicore
cluster. Ini lebih cepat daripada rekan-rekan multithreaded (akhir 2015) untuk jumlah core yang sama dan, berkat teknologi pesan-passing, itu dapat dieksekusi pada cluster.
Ada juga mitra MapReduce dari ParDRe, yang disebut MarDRe (lihat tautan di atas).
PEMBARUAN: Dari versi 2.0.5 ParDRe juga menyediakan dukungan untuk menghapus hanya duplikat optik (dan meninggalkan duplikat yang menarik secara biologis) serta bekerja dengan input/output terkompresi dengan format .gz.
Para penonton
Teknologi Informasi, Industri Kesehatan, Sains/Penelitian
User interface
Konsol/Terminal, Baris Perintah
Bahasa Pemrograman
C + +
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/pardre/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
