Ini adalah aplikasi Linux bernama QUASR yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai QUASR_v6.08.tar. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama QUASR ini dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
QUASR
DESKRIPSI
QUASR adalah pipeline ringan yang ditulis untuk memproses dan menganalisis data next-generation sequencing (NGS) dari platform Illumina, 454, dan Ion Torrent. Meskipun awalnya ditulis untuk data viral, ini cukup umum untuk bekerja pada kumpulan data NGS apa pun. Fungsi meliputi:
penghapusan duplikat
demultiplexing
penghapusan primer
grafik jaminan kualitas (QA)
kontrol kualitas (QC)
generasi konsensus
penentuan varian minoritas
grafik varian minoritas
Versi utama saat ini adalah 6.X, yang ditulis dengan Python3. 7.X adalah penulisan ulang saya di Jawa, tetapi masih dalam proses. Keduanya ditulis untuk seringan mungkin sehingga dapat berjalan dengan kebutuhan memori minimal pada desktop atau laptop serta pada cluster komputasi.
Jika Anda memiliki masalah dengan QUASR, silakan hubungi saya di alamat email yang disediakan di README.
Para penonton
Sains/Penelitian
User interface
Garis komando
Bahasa Pemrograman
Ular sanca
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/quasr/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
