Ini adalah aplikasi Linux bernama VarScan yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai VarScan.v2.3.9.jar. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama VarScan dengan OnWorks ini secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
Pemindaian Var
DESKRIPSI
Deteksi varian dalam pengurutan paralel besar-besaran. Untuk satu sampel, panggil genotipe SNP, indel, dan konsensus. Untuk pasangan tumor-normal, mengklasifikasikan lebih lanjut setiap varian sebagai Germline, Somatic, atau LOH, dan juga mendeteksi perubahan nomor salinan somatik. VERSI TERBARU TERSEDIA DI GITHUB
Fitur
- Memanggil SNP dan Indel dari file pileup SAMtools
- Filter varian berdasarkan cakupan, kedalaman baca, frekuensi varian, dan kualitas dasar
- Menentukan status somatik (Somatic, Germline, LOH) untuk pasangan Tumor-Normal
- Membandingkan, menggabungkan, dan memotong dua daftar varian
- Membatasi panggilan varian ke serangkaian posisi target atau wilayah target
- Gratis untuk penggunaan non-komersial.
Para penonton
Sains/Penelitian
User interface
Garis komando
Bahasa Pemrograman
Jawa
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/varscan/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.