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afetch - Online nel cloud

Esegui afetch nel provider di hosting gratuito OnWorks su Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS

Questo è il comando afetch che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS

PROGRAMMA:

NOME


afetch - recupera un allineamento da un database di allineamento

SINOSSI


accaparrarsi [opzioni] allineamentodb chiave

accaparrarsi --indice allineamentodb

DESCRIZIONE


accaparrarsi recupera l'allineamento denominato chiave da un database di allineamento in file allineamentodb.

allineamentodb è un file di "allineamento multiplo multiplo" a Stoccolma (ad es. Pfam nativo)
formato.

chiave è il nome (ID) dell'allineamento o il suo numero di accesso (AC).

. allineamentodb il file deve essere prima indicizzato SSI con accaparrarsi --indice per efficiente
recupero. Non è richiesto un indice SSI, ma il recupero dell'allineamento senza uno può essere
dolorosamente lento.

VERSIONI


-h Stampa breve guida; include il numero di versione e il riepilogo di tutte le opzioni, incluso
opzioni per esperti.

EXPERT VERSIONI


--indice
Invece di recuperare un chiave, il comando speciale accaparrarsi --indice allineamentodb
produce un indice SSI dei nomi e delle accessioni degli allineamenti nel file
allineamentodb. Questo dovrebbe essere eseguito una volta sul allineamentodb file per prepararlo per tutti
futuri attacchi.

Utilizzare afetch online utilizzando i servizi onworks.net


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