Questo è il comando afetch che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
afetch - recupera un allineamento da un database di allineamento
SINOSSI
accaparrarsi [opzioni] allineamentodb chiave
accaparrarsi --indice allineamentodb
DESCRIZIONE
accaparrarsi recupera l'allineamento denominato chiave da un database di allineamento in file allineamentodb.
allineamentodb è un file di "allineamento multiplo multiplo" a Stoccolma (ad es. Pfam nativo)
formato.
chiave è il nome (ID) dell'allineamento o il suo numero di accesso (AC).
. allineamentodb il file deve essere prima indicizzato SSI con accaparrarsi --indice per efficiente
recupero. Non è richiesto un indice SSI, ma il recupero dell'allineamento senza uno può essere
dolorosamente lento.
VERSIONI
-h Stampa breve guida; include il numero di versione e il riepilogo di tutte le opzioni, incluso
opzioni per esperti.
EXPERT VERSIONI
--indice
Invece di recuperare un chiave, il comando speciale accaparrarsi --indice allineamentodb
produce un indice SSI dei nomi e delle accessioni degli allineamenti nel file
allineamentodb. Questo dovrebbe essere eseguito una volta sul allineamentodb file per prepararlo per tutti
futuri attacchi.
Utilizzare afetch online utilizzando i servizi onworks.net
