bp_chaos_plotp - Online nel cloud

PROGRAMMA:

NOME

bp_chaos_plot - un diagramma del caos da sequenze di DNA e RNA

SINOSSI

bp_chaos_plot.pl -i/--input=INPUTFILE -f/--format=SEQFORMAT
-o/--output=OUTPUTFILE -g/--graphics=FORMATO GRAFICO
-w/--larghezza=WIGHT -h/--height=ALTEZZA

DESCRIZIONE

Questo script genera file di immagine utilizzando la libreria di immagini GD per visualizzare il nucleotide
sequenze usando la trama del caos.

VERSIONI

I formati grafici validi sono attualmente gd, gd2, png, wbmp, jpeg e gif.

La dimensione predefinita del file immagine è 600x400.

L'input della sequenza può essere fornito utilizzando uno dei tre metodi:

argomento senza nome
bp_chaos_plot nome file

argomento chiamato
bp_chaos_plot -i nomefile

input standard
bp_chaos_plot < nome file

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AUTORE - Jason Stajic

E-mail [email protected]

STORIA

Questo codice è basato sul codice EMBOSS C per caos.c di Ian Longden. Sono inclusi
documentazione dal codice EMBOSS:

Il caos produce una trama del caos. L'applicazione originale fa parte del genoma ACEDB
pacchetto database, scritto da ** Richard Durbin (MRC LMB, UK) [email protected]e
Jean Thierry-Mieg (CRBM du CNRS, Francia) [email protected]

Usa bp_chaos_plotp online utilizzando i servizi onworks.net