Questo è il comando cassiopee che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
cassiopee - pagina man per Cassiopee versione 1.0
SINOSSI
cassiope [Opzioni]
DESCRIZIONE
Uso:
-l: profondità massima dell'indice / dimensione massima del pattern
-u: salva l'indice per un uso successivo
-s: sequenza per indicizzare
-p: modello da cercare
-f: file contenente il pattern da cercare
-o: file di uscita
-r: applica la riduzione dell'albero
-m: modalità di ricerca: 0=DNA, 1=RNA, 2=Proteine
-a: consenti la ricerca per ambiguità alfabetica
-n: massimo N consecutivi corrispondenze consentite nella ricerca
-e: sostituzione massima consentita corrispondenze nella ricerca
-i: max indel corrispondenze consentite nella ricerca
-g: genera un file di punti del grafico
-d: profondità massima del grafico
-t: formato di output: 0:tsv (predefinito), 1:json
-x: posizione minima in sequenza
-y: posizione massima in sequenza
-v: mostra la versione
-h: mostra questo messaggio
Usa cassiopee online utilizzando i servizi onworks.net
