Questo è il comando cm_to_wigeon che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre numerose workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, l'emulatore online di Windows o l'emulatore online di MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
cm_to_wigeon - helper per wigeon (rilevamento delle anomalie del DNA del codone 16S)
DESCRIZIONE
Purtroppo questo strumenti che viene in veloce con fischione(1) is non è un documentata ma it
Saluti , il Opzioni qua sotto. If Tu sapere better informazioni la sua scopo per favore cadere us a Nota
utilizzando segnala un errore on il tuo Debian .
VERSIONI
richiesto:
--query_NAST
file multi-fasta contenente sequenze di query in formato di allineamento
--db_NAST
db in formato NAST
--db_FASTA
db in formato fasta (formattato megablast)
Uncommon Opzioni
-n numero di sequenze di database corrispondenti principali con cui effettuare il confronto (predefinito 15)
-R rapporto di divergenza minimo predefinito: 1.007
-P percentuale minima di identità tra sequenze corrispondenti (predefinito 90)
Scheda Sintetica a sintonizzare ChimeraMaligner:
Parametri di punteggio:
-M punteggio della partita (predefinito: +5)
-N penalità per mancata corrispondenza (predefinita: -4)
-Q copertura minima delle query tramite la sequenza del database corrispondente (predefinito: 70)
-T numero massimo di traverse dell'allineamento multiplo (predefinito: 1)
Bandiere:
--stampaAllineamenti
(disattivato per impostazione predefinita)
-v verboso
--exec_dir
cd qui prima di eseguire
Utilizzare cm_to_wigeon online utilizzando i servizi onworks.net
