cmtk-reformatx - Online nel cloud

PROGRAMMA:

NOME

reformatx - Riformattatore di volumi

SINOSSI

reformatx [opzioni] --floating floatingImg target x0 [x1 ...]
OPPURE riformattax [opzioni] target [x0 x1 ...] {-j,--jacobian} xx0 [xx1 ...]
O DOVE x0 ... xN e xx0 ... xxN è [{-i,--inverse}] trasformazione##. (Se il primo
la trasformazione nella sequenza è invertita, quindi '--inverse' deve essere preceduto da '--',
cioè, usa '-- --inverse xform.path').

DESCRIZIONE

Strumento di riformattazione del volume esteso per calcolare immagini riformattate e mappe jacobiane da
sequenze arbitrarie di trasformazioni concatenate

VERSIONI

globali Kit di strumenti Opzioni (questi sono condiviso by contro tutti i CMTK utensili)
--Aiuto
Scrivere l'elenco delle opzioni di base della riga di comando nell'output standard.

--aiuto-tutti
Scrivere l'elenco completo delle opzioni della riga di comando di base e avanzate nell'output standard.

--wiki
Scrivi l'elenco delle opzioni della riga di comando nell'output standard nel markup di MediaWiki.

--uomo
Scrivi il sorgente della pagina man nel markup 'nroff' sullo standard output.

--versione
Scrivi la versione del toolkit nell'output standard.

--eco
Scrive la riga di comando corrente nell'output standard.

--livello-verboso
Imposta il livello di verbosità.

--verboso, -v
Incrementa il livello di verbosità di 1 (deprecato; supportato per compatibilità con le versioni precedenti).

--thread
Imposta il numero massimo di thread paralleli (per thread POSIX e OpenMP).

--tipo di uscita
Tipo di dati scalari per l'immagine di output. Valori supportati: "char", "byte", "short",
"ushort", "int", "uint", "float", "double" o utilizzare uno dei seguenti:

--char
8 bit, firmato

--byte
8 bit, senza segno

--breve
16 bit, firmato

--ubreve
16 bit, senza segno

--int
32 bit firmati

--uint
32 bit senza segno

--galleggiante
32 bit in virgola mobile

--Doppio
64 bit in virgola mobile

--pad-out , -P
Valore di riempimento per l'immagine di output [Predefinito: 0]

Opzioni per pianura La riformattazione
--interpolazione
Metodo di interpolazione delle immagini. Valori supportati: "linear", "nn", "cubic", "pv", "sinc-
coseno", "sinc-hamming", dove il valore predefinito è "lineare", oppure utilizzare uno dei seguenti:

--lineare
Interpolazione trilineare [Questo is , il predefinito]

--nn Interpolazione del vicino più vicino

--cubo
Interpolazione tricubica

--pv Interpolazione del volume parziale

--sinc-coseno
Interpolazione sinc con finestra del coseno

--sinc-hamming
Sinc interpolazione con finestra di Hamming

--sinc-finestra-raggio
Raggio della finestra per l'interpolazione Sinc [Predefinito: 3]

--preserva-massa
Riformattazione con conservazione della massa: moltiplicare ogni valore riformattato con lo Jacobiano
determinante della trasformazione applicata.

Opzioni per Jacobiano Mappa La riformattazione
--jacobian-corretto-globale
Mappe Jacobiane corrette per scala globale.

--no-jacobian-correct-global
Non correggere le mappe jacobiane per la scala globale. [Questo is , il predefinito]

Ingresso Opzioni
--griglia di destinazione
Definisci la griglia di destinazione per la riformattazione come Nx,Ny,Nz:dX,dY,dZ[:Ox,Oy,Oz]
(diminuisce: pixel: offset)

--maschera, -m
Usa i dati del pixel di destinazione come maschera binaria.

--Ritaglia
Ritaglia l'immagine di destinazione: x0,y0,z0,x1,y1,z2

--offset di destinazione , -O
Ignora l'offset dell'immagine di destinazione e imposta su x,y,z mm

--target-offset-pixel
Sostituisci l'offset dell'immagine di destinazione e imposta i pixel dx,dy,dz

--galleggiante , -F
Formato e percorso dell'immagine mobile. [Predefinito: NESSUNO]

--pad-flottante
Valore di riempimento per l'immagine mobile [Predefinito: Disabilitato]

Uscita Opzioni
--file di uscita , -o
Formato e percorso dell'immagine di output. [Predefinito: riformattare.nii ]

Immagine/Trasformazione Banca Dati
--db
Percorso al database di immagini/trasformazioni che dovrebbe essere aggiornato con il nuovo creato
immagine. [Predefinito: NESSUNO]

AUTORI

Torsten Rohlfing, con contributi di Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff e Yaroslav Halchenko

Usa cmtk-reformatx online utilizzando i servizi onworks.net