Questo è il comando drr che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
drr: crea una radiografia ricostruita digitalmente
SINOSSI
dott [opzioni] [in file]
DESCRIZIONE
Una radiografia ricostruita digitalmente (DRR) è una radiografia sintetica che può essere
generato da una scansione di tomografia computerizzata (CT). Viene utilizzato come immagine di riferimento per
verificare la corretta posizione di installazione di un paziente prima del trattamento con radiazioni.
DRR USO
Il programma drr fornito con Plastimatch prende un'immagine CT come input e ne genera una
o più immagini di output. L'immagine di input è in formato MHA e le immagini di output possono esserlo
in formato pgm, pfm o raw. L'utilizzo della riga di comando è:
Utilizzo: drr [opzioni] [file interno]
Opzioni:
-A hardware O "cpu" o "cuda" (default=cpu)
-a num Genera num angoli equidistanti
-N angolo Differenza tra angoli vicini (in gradi)
-nrm "xy z" Imposta il vettore normale per il pannello
-vup "x y z" Imposta il vettore vup (verso la riga superiore) per il pannello
-g "sad sid" Imposta il triste, sid (in mm)
-r "rc" Imposta la risoluzione di output (in pixel)
-s scale Ridimensiona l'intensità del file di output
-e Esegue la mappatura esponenziale dei valori di output
-c "r c" Imposta il centro dell'immagine (in pixel)
-z "s1 s2" Imposta la dimensione fisica dell'imager (in mm)
-w "r1 r2 c1 c2" Produce solo l'immagine per i pix nella finestra (in pix)
-t outformat Seleziona il formato di output: pgm, pfm o raw
-i algoritmo Scegli l'algoritmo {esatto,uniforme}
-o "o1 o2 o3" Imposta la posizione dell'isocentro
-I infile Imposta il file di input in formato mha
-O outprefix Genera file di output utilizzando il prefisso specificato
Il programma drr può essere utilizzato in entrambi i casi singolo Immagine modo or rotazionale modo. Nel singolo
modalità immagine, si specifica la geometria completa della sorgente radiografica e del pannello di imaging per a
singola immagine. In modalità rotazionale, si presuppone che la geometria dell'immagine sia
Le opzioni della riga di comando sono descritte più dettagliatamente di seguito.
-A hardware
Scegli la modalità di threading, che è "cpu" o "cuda". Il valore predefinito è
"processore".
Quando si utilizza l'hardware della CPU, la generazione DRR utilizza OpenMP per l'accelerazione multicore se
il tuo compilatore lo supporta. Gcc e Microsoft Visual Studio Professional
i compilatori supportano OpenMP, ma Microsoft Visual Studio Express no.
Al momento, l'accelerazione cuda non funziona.
-a num Genera num angoli equidistanti
-r "r1 r2"
Imposta la risoluzione del pannello immagini (in pixel). Qui, r1 si riferisce al numero
di righe e r2 si riferisce al numero di colonne.
SINGLE IMMAGINE MODE
L'esempio seguente illustra l'uso della modalità immagine singola:
drr -nrm "1 0 0" \
-vup "0 0 1" \
-g "1000 1500" \
-r "1024 768" \
-z "400 300" \
-c "383.5 511.5" \
-o "0 -20 -50" \
input_file.mha
Nell'esempio sopra, l'isocentro viene scelto come (0, -20, -50), la posizione contrassegnata
l'immagine TC. L'orientamento dell'immagine di proiezione è controllato da nr ed vup
opzioni. Utilizzando i valori predefiniti di (1, 0, 0) e (0, 0, 1) si ottiene il DRR mostrato sul
a destra: [immagine] [immagine]
Modificando la direzione normale (nr), possiamo scegliere diverse direzioni del raggio all'interno di an
orbita isocentrica. Ad esempio, una DRR antero-posteriore (AP) viene generata con una normale
di (0, -1, 0) come mostrato di seguito: [immagine]
La rotazione del pannello immagini viene selezionata utilizzando vup opzione. Il valore predefinito di
vup è (0, 0, 1), il che significa che la parte superiore del pannello è orientata verso la z positiva
direzione nelle coordinate mondiali. Se volessimo ruotare il pannello di 45 gradi
in senso antiorario sulla nostra vista AP, imposteremmo vup nella direzione (1, 0, 1), come mostrato in
l'immagine qui sotto. Notare che vup non deve essere normalizzato. [Immagine]
ROTAZIONALE MODE
In modalità rotazione vengono create più immagini. Si presuppone la sorgente e il pannello di imaging
ruotare su un'orbita circolare attorno all'isocentro. Viene eseguita l'orbita circolare
attorno all'asse Z e le immagini vengono generate ogni -N ang gradi dell'orbita. Questo
è illustrato utilizzando il seguente esempio:
drr -N 20 \
-a 18 \
-g "1000 1500" \
-r "1024 768" \
-z "400 300" \
-o "0 -20 -50" \
input_file.mha
Nell'esempio sopra, vengono generate 18 immagini a un intervallo di 20 gradi, come segue: [immagine]
Utilizza drr online utilizzando i servizi onworks.net
