Questo è il comando fastaq-trim_contigs che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
fastaq_trim_contigs - Taglia un determinato numero di basi dalla fine di ogni contig
DESCRIZIONE
utilizzo: fastaq_trim_contigs [opzioni]
Taglia un determinato numero di basi dalla fine di ogni contig, quindi gli spazi diventano più grandi e contigui
le estremità vengono rimosse. Le basi vengono sostituite con Ns. Qualsiasi sequenza che finisce come tutte le N è persa
posizionale argomenti:
infile Nome del file di input
file di uscita
Nome del file di output
opzionale argomenti:
-h, --Aiuto
mostra questo messaggio di aiuto ed esci
--numero_rifilatura TRIM_NUMERO
Numero di basi da tagliare attorno a ogni spazio vuoto e fuori le estremità di ogni sequenza [100]
Usa fastaq-trim_contigs online utilizzando i servizi onworks.net
