Questo è il comando fix-trinity-output che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
fix-trinity-output - Corregge i file fastq di output da Trinity
DESCRIZIONE
Trinity emette file fastq che sono stati "corretti"
Sfortunatamente questi file non sono più accoppiati correttamente e quindi non possono essere utilizzati in
la maggior parte degli allineatori come bowtie2 e snap
Questo script tenta di risolvere il problema e produce 2 file fastq correttamente accoppiati e un fastq
file contenente letture singole
VERSIONI
--sinistra, -l :
file fastq di letture a sinistra
--Giusto, -r :
file fastq di letture giuste
--produzione, -o :
prefisso di uscita
--Aiuto, -h:
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Usa l'output di fix-trinity online utilizzando i servizi onworks.net