Questo è il comando gmx-pme_error che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
gmx-pme_error - Stima l'errore di utilizzo di PME con un dato file di input
SINOSSI
gmx pme_errore [-s [<.tpr>]] [-o [<.out>]] [-così [<.tpr>]] [-beta ]
[-[nessuna] melodia] [-se stesso ] [semi ] [-[n]v]
DESCRIZIONE
gmx pme_errore stima l'errore delle forze elettrostatiche se si utilizza l'algoritmo sPME.
La bandiera -tune determinerà il parametro di suddivisione in modo tale che l'errore sia uguale
distribuito sulla parte spaziale reale e reciproca. La parte dell'errore che deriva
dall'autointerazione delle particelle è computazionalmente impegnativo. Tuttavia, un buon a
l'approssimazione consiste nell'usare solo una frazione delle particelle per questo termine che può essere
indicato dalla bandiera -se stesso.
VERSIONI
Opzioni per specificare i file di input:
-s [<.tpr>] (topol.tpr)
File di input per eseguire xdr portatile
Opzioni per specificare i file di output:
-o [<.out>] (errore.out)
File di output generico
-così [<.tpr>] (sintonizzato.tpr) (Facoltativo)
File di input per eseguire xdr portatile
Altre opzioni:
-beta (-1)
Se positivo, sovrascrivi ewald_beta da .tpr file con questo valore
-[nessuna] melodia (In)
Regolare il parametro di suddivisione in modo tale che l'errore sia equamente distribuito tra
spazio reale e reciproco
-se stesso (1)
Se tra 0.0 e 1.0, determinare l'errore di interazione automatica solo da questa frazione di
le particelle cariche
semi (0)
Seme di numeri casuali utilizzato per l'algoritmo Monte Carlo quando -se stesso è impostato su un valore
tra il 0.0 e 1.0
-[n]v (In)
Sii forte e rumoroso
Usa gmx-pme_error online usando i servizi onworks.net
