Questo è il comando gmx-sigeps che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
gmx-sigeps - Converti combinazioni c6/12 o c6/cn da e verso sigma/epsilon
SINOSSI
gmx sigep [-o [<.xvg>]] [-[Ora] [-xvg ] [-c6 ]
[-cn ] [-potere ] [-sig ] [-eps ]
[-A ] [-B ] [-C ] [-Qi ]
[-qj ] [-sigfac ]
DESCRIZIONE
gmx sigep è una semplice utility che converte le combinazioni C6/C12 o C6/Cn in sigma e
epsilon, o viceversa. Può anche tracciare il potenziale in un file. Inoltre, fa un
approssimazione di un potenziale di Buckingham a un potenziale di Lennard-Jones.
VERSIONI
Opzioni per specificare i file di output:
-o [<.xvg>] (potje.xvg)
file xvgr/xmgr
Altre opzioni:
-[Ora (In)
Visualizza output .xvg, .xpm, .eps ed PDB file
-xvg
formattazione della trama xvg: xmgrace, xmgr, none
-c6 (0.001)
C6
-cn (1e-06)
Costante per la repulsione
-potere (12)
Potenza del termine di repulsione
-sig (0.3)
sigma
-eps (1)
epsilon
-A (100000)
Buckingam A
-B (32)
Buckingham B
-C (0.001)
Buckingham C
-Qi (0)
qi
-qj (0)
qj
-sigfac (0.7)
Fattore davanti a sigma per iniziare la trama
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