Questo è il comando idconvert che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
idconvert — Converti i formati di file di identificazione della spettrometria di massa.
SINOSSI
idconvert [opzioni] [filemaschere]
DESCRIZIONE
Questa pagina di manuale documenta brevemente il idconvert software spedito all'interno del strumenti libpwiz
pacchetto. Questo programma consente di convertire i dati di identificazione delle proteine mediante spettrometria di massa
file da un formato all'altro.
VERSIONI
-v | --verboso
Visualizza informazioni dettagliate sullo stato di avanzamento dell'elaborazione.
-f | --elenco file Nome del file
Utilizza il contenuto di Nome del file che elenca i nomi dei file.
-o | --dir dir
Imposta la directory di output ('-' per stdout) su dir. Per impostazione predefinita, l'uscita
la directory è '.' (ovvero, la directory di lavoro corrente).
-c | --config Nome del file
Imposta il file di configurazione su Nome del file.
-e | --est ext
Imposta l'estensione dei file di output su ext. Può essere mzid o pepXML o txt.
--mzIdentML
Scrivi mzIdentML formato (predefinito).
--pepXML Scrivi pepXML formato.
--text Scrivi gerarchico testo formato.
ESEMPI
Converti sequest.pepXML in sequest.mzid
idconvert sequest.pepXML
Converti mascot.mzid in mascot.pepXML
idconvert mascotte.mzid --pepXML
Usa un file di configurazione
idconvert xtandem.pep.xml -c Config.txt
RITORNO VALORE
Il numero di file non riusciti.
Usa idconvert online utilizzando i servizi onworks.net