Questo è il comando kmc_tools-intersect che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
kmc_tools-intersect - calcola l'intersezione di due database KMC
SINOSSI
kmc_tools intersecare <output
[parametri_output]>
DESCRIZIONE
Il database di output conterrà solo k-mer che sono presenti in entrambi i set di input. Il
il valore del contatore nel database di output è uguale al valore del contatore inferiore nell'input.
VERSIONI
Per ogni ingresso ci sono parametri aggiuntivi:
-ci
escludere k-mer che si verificano meno di volte
-cx
escludere k-mer che si verificano più di volte
Per l'output ci sono parametri aggiuntivi:
-ci
escludere k-mer che si verificano meno di volte
-cx
escludere k-mer che si verificano più di volte
-cs
valore massimo di un contatore
ESEMPIO
kmc -k28 file1.fastq kmers1 tmp
kmc -k28 file2.fastq kmers2 tmp
kmc_tools intersecano kmers1 -ci10 -cx200 kmers2 -ci4 -cx100 kmers1_kmers2_intersect -ci20 -cx150
Usa kmc_tools-intersect online utilizzando i servizi onworks.net
