Questo è il comando last-dotplot che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
last-dotplot - crea un dotplot, noto anche come Oxford Grid, di allineamenti in LAST formato tabulare
SINOSSI
ultimo dotplot --Aiuto
ultimo dotplot [Opzioni] allineamenti-maf-o-tab dotplot.png
ultimo dotplot [Opzioni] allineamenti-maf-o-tab dotplot.gif
...
DESCRIZIONE
Disegna un dotplot di allineamenti di sequenze a coppie in formato MAF o tabulare.
VERSIONI
-h, --Aiuto
mostra questo messaggio di aiuto ed esci
-1 MODELLO, --seq1=MODELLO
quali sequenze mostrare dal 1° genoma
-2 MODELLO, --seq2=MODELLO
quali sequenze mostrare dal 2° genoma
-x LARGHEZZA, --larghezza=LARGHEZZA
larghezza massima in pixel (predefinito: 1000)
-y ALTEZZA, --altezza=ALTEZZA
altezza massima in pixel (predefinito: 1000)
-f FILE, --file font=RISORSE
File di caratteri TrueType o OpenType
-s DIMENSIONE, --dimensione del font=TAGLIA
Dimensione carattere TrueType o OpenType (predefinito: 11)
-c COLORE, --forwardcolor=COLORE
colore per gli allineamenti in avanti (predefinito: rosso)
-r COLORE, --colore inverso=COLORE
colore per allineamenti inversi (predefinito: blu)
Opzioni di gap non in sequenza:
--gap1=RISORSE
leggere i gap non sequenziati del genoma1 da agp o file gap
--gap2=RISORSE
leggere i gap non sequenziati del genoma2 da agp o file gap
--colore-ponte=COLORE
colore per gli spazi colmati (predefinito: giallo)
--colore-senza ponte=COLORE
colore per gli spazi non colmati (predefinito: rosa)
Usa last-dotplot online utilizzando i servizi onworks.net
