Questo è il comando makemat che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici postazioni di lavoro online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
makemat - converte i profili binari in un formato ASCII portatile
SINOSSI
makemat [-] [-E N] [-G N] [-H] [-P Nome del file] [-S X] [-U str] [-d str] [-z N]
DESCRIZIONE
makemat converte una raccolta di profili binari, creata dal -C opzione di PSI-BLAST,
in formato ASCII portatile.
VERSIONI
Di seguito è riportato un riepilogo delle opzioni.
- Stampa messaggio di utilizzo
-E N Costo per estendere un divario (predefinito = 1)
-G N Costo per aprire un gap (predefinito = 11)
-H Guida alla stampa; sovrascrive tutti gli altri argomenti
-P Nome del file
Nome del database per il database dei profili (predefinito = stdin)
-S X Fattore di scala per gli output della matrice per evitare problemi di arrotondamento (predefinito = 100)
-U str Matrice sottostante (predefinito = BLOSUM62)
-d str Database della sequenza sottostante utilizzato per creare profili (predefinito = nr)
-z N Lunghezza effettiva del database dei profili (0 per lunghezza di -d opzione)
Usa makemat online utilizzando i servizi onworks.net
