Questo è il comando mbfa che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici postazioni di lavoro online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
mbfa - Convertitore di formati Murasaki Binary FASTA
SINOSSI
mbfa [opzioni...] [input] [input2 ...] #convert [input] e [input2 ...] in file Muraaski Binary FASTA
DESCRIZIONE
Murasaki elabora i dati di sequenza utilizzando un formato a 2 bit in cui ogni base viene rappresentata utilizzando
2 bit. Esistono numerosi formati preesistenti che fanno cose simili, tuttavia in
particolare Murasaki ha bisogno di conoscere i metadati che non possono essere espressi in soli 2
bit (ad es. dove sono le sequenze di NNNN, la sequenza si interrompe quando sono presenti più sequenze
incluso in un file FASTA, ecc.), quindi il formato MBFA include anche questi dati.
Normalmente questi file vengono generati automaticamente da Murasaki quando vengono eseguiti per la prima volta su un nuovo
sequenza.
Poiché il formato del file è progettato in stretta sintonia con Murasaki, l'effettiva estensione del file
varierà per riflettere la tua architettura. In genere sarà una qualche forma di .mbfa[48][48]
(es. ".mbfa88" (la build predefinita di gcc su un amd64)).
VERSIONI
--info|-i
Mostra i metadati su ogni MBFA specificato.
--forza|-f
Di default mbfa salterà i file che hanno già file .mbfa recenti. Questa opzione
forza la rigenerazione di questi file.
--fatale|-F
Rende fatali gli errori. Normalmente se specifichi più file, mbfa proverà a convertire
tutti anche se uno non emette un avvertimento. Con --fatal si fermerà e uscirà
con un errore se c'è un problema.
--fasta|-A
Genera l'output FASTA corrispondente in base ai dati MBFA a stdout.
--help|-h, --version|-V, --verbose|-V
Quello che ti aspetteresti.
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