mia-3dgetslice - Online nel cloud

PROGRAMMA:

NOME

mia-3dgetslice - Estrae sezioni da un'immagine 3D.

SINOSSI

mia-3dgetslice -i -o [opzioni]

DESCRIZIONE

mia-3dgetslice Questo programma viene utilizzato per estrarre sezioni 2D da un set di dati 3D e memorizzarle
in file separati. I file di output saranno numerati in base al loro indice di sezione.

VERSIONI

-i --in-file=(input, richiesto); io
immagini di input da filtrare Per i tipi di file supportati vedere
PLUGIN:3dimage/io

-o --out-file=(output, richiesto); io
immagini in uscita. Se numero != 1 di questo viene utilizzato come nome di base e dovrebbe
essere fornito senza estensione poiché questo sarà basato sull'opzione '--type'.
Se numero=1, verrà utilizzato questo nome file esatto. Per file supportati
tipi vedi PLUGIN:2dimage/io

-t --tipo=png
tipo di file di output per numero!= 1
supportato valori sono:( bpm, pool di dati, dicom, exr, jpg, PNG, crudo,
tif, vista, )

-s --inizio=0
inizia il numero della fettainizia il numero della fetta

-n --numero=1
numero di fette (all=0)numero di fette (all=0)

--cifre=4
numero minimo di cifre del nome del file numeri (se n != 1)numero minimo
di cifre dei numeri del nome del file (se n != 1)

-d --dir=xy
direzione della fetta (xy=assiale, xz=coronale, yz=saggitale)
xz ‐ ottieni xz (coronale) slice
yz ‐ prendi yz (saggitale) slice
xy ‐ ottieni xy (assiale) slice

Aiuto & Info
-V --verbose=avvertimento
verbosità dell'output, stampa messaggi di un dato livello e priorità più alte.
Le priorità supportate a partire dal livello più basso sono:
info ‐ Messaggi di basso livello
tracciare ‐ Traccia chiamata funzione
fallire ‐ Segnalare i fallimenti dei test
identificazione dei warning ‐ Avvertenze
errore ‐ Segnala errori
mettere a punto ‐ Uscita di debug
messaggio ‐ Messaggi normali
fatale ‐ Segnala solo errori fatali

--diritto d'autore
stampa le informazioni sul copyright

-h --aiuto
stampa questo aiuto

-? --uso
stampa un breve aiuto

--versione
stampa il numero di versione ed esci

Processando
--thread=-1
Numero massimo di thread da utilizzare per l'elaborazione, questo numero dovrebbe essere inferiore
o uguale al numero di core del processore logico nella macchina. (-1:
stima automatica).Numero massimo di thread da utilizzare per l'elaborazione,Questo
il numero deve essere inferiore o uguale al numero di core del processore logico in
la macchina. (-1: stima automatica).

PLUGIN: immagine 2d/io

bmp Supporto per input/output di immagini 2D BMP

Estensioni file riconosciute: .BMP, .bmp

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit senza segno, 16 bit senza segno

pool di dati IO virtuale da e verso il pool di dati interno

Estensioni di file riconosciute: .@

dicom Immagine 2D io per DICOM

Estensioni file riconosciute: .DCM, .dcm

Tipi di elementi supportati:
16 bit con segno, 16 bit senza segno

EXR un plugin io 2dimage per immagini OpenEXR

Estensioni file riconosciute: .EXR, .exr

Tipi di elementi supportati:
32 bit senza segno, 32 bit in virgola mobile

jpg un plugin io 2dimage per immagini jpeg in scala di grigi

Estensioni file riconosciute: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

Tipi di elementi supportati:
8 bit senza segno

png un plugin io 2dimage per immagini png

Estensioni file riconosciute: .PNG, .png

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit senza segno, 16 bit senza segno

crudo Supporto per l'output di immagini 2D RAW

Estensioni file riconosciute: .RAW, .raw

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno,
32 bit con segno, 32 bit senza segno, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64
bit

tif Supporto ingresso/uscita immagini TIFF 2D

Estensioni file riconosciute: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit senza segno, 16 bit senza segno, 32 bit senza segno

vista un plugin io 2dimage per le immagini di vista

Estensioni file riconosciute: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno,
32 bit con segno, 32 bit senza segno, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64
bit

PLUGIN: immagine 3d/io

analizzare Analizza immagine 7.5

Estensioni file riconosciute: .HDR, .hdr

Tipi di elementi supportati:
8 bit senza segno, 16 bit con segno, 32 bit con segno, 32 bit con virgola mobile,
virgola mobile 64 bit

pool di dati IO virtuale da e verso il pool di dati interno

Estensioni di file riconosciute: .@

dicom Serie di immagini Dicom in 3D

Estensioni file riconosciute: .DCM, .dcm

Tipi di elementi supportati:
16 bit con segno, 16 bit senza segno

hdf5 I/O immagine 5D HDF3

Estensioni file riconosciute: .H5, .h5

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno,
32 bit con segno, 32 bit senza segno, 64 bit con segno, 64 bit senza segno, flottante
punto 32 bit, virgola mobile 64 bit

inria immagine INRIA

Estensioni file riconosciute: .INR, .inr

Tipi di elementi supportati:
8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno, 32 . con segno
bit, unsigned 32 bit, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64 bit

mhd Immagine MetaIO 3D IO utilizzando l'implementazione VTK (sperimentale).

Estensioni file riconosciute: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Tipi di elementi supportati:
8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno, 32 . con segno
bit, unsigned 32 bit, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64 bit

elegante NIFTI-1 immagine 3D IO

Estensioni file riconosciute: .NII, .nii

Tipi di elementi supportati:
8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno, 32 . con segno
bit, 32 bit senza segno, 64 bit con segno, 64 bit senza segno, virgola mobile 32
bit, virgola mobile 64 bit

vff VFF Sun formato raster

Estensioni file riconosciute: .VFF, .vff

Tipi di elementi supportati:
8 bit senza segno, 16 bit con segno

vista vista 3D

Estensioni file riconosciute: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno,
32 bit con segno, 32 bit senza segno, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64
bit

VTI Immagine 3D VTK-XML in entrata e in uscita (sperimentale).

Estensioni file riconosciute: .VTI, .vti

Tipi di elementi supportati:
8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno, 32 . con segno
bit, unsigned 32 bit, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64 bit

vk Ingresso e uscita legacy dell'immagine 3D VTK (sperimentale).

Estensioni file riconosciute: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno,
32 bit con segno, 32 bit senza segno, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64
bit

ESEMPIO

Memorizza 5 fette coronali a partire dalla fetta 120 coronalXXXX.png da image.v.

mia-3dgetslice -i image.v -o coronale -t png -n 5 -s 120

AUTORE(i)

Gert Wollny

COPYRIGHT

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LICENZA PUBBLICA GENERALE Versione 3 (o successiva). Per maggiori informazioni eseguire il programma con il
opzione '--copyright'.

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