Questa è l'app Linux denominata Athus la cui ultima versione può essere scaricata come Athus-1.8.9.2-sources.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata Athus con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
Atus
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DESCRIZIONE
Questo progetto ti assiste nell'esecuzione di analisi genetiche della popolazione assumendo le fasi di manipolazione dei dati brutte, noiose e soggette a errori.
Partendo da formati di input ben specificati VCF, BED e FASTA e un file di configurazione univoco che descrive i dati (ad esempio da array SNP o sequenziamento) e filtrando, è possibile creare formati POPGEN standard come Eigenstrat, PEDMAP (PLINK), Treemix ...
Inoltre ci sono diverse utilità per
* generazione di VCF da dati SNPArray (file di chiamata NCBI - GEO, Illumina)
* lavorare con mappe genetiche...
Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Console/terminale, riga di comando
Linguaggio di programmazione
Java
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/bioathus/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.