Questa è l'app Linux denominata CAMPARI da eseguire in Linux online la cui ultima versione può essere scaricata come campari_v3_09052017.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata CAMPARI per l'esecuzione in Linux online con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
CAMPARI per funzionare in Linux online
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DESCRIZIONE
Siamo orgogliosi di presentare la versione 3 di CAMPARI. Questo è un grande passo avanti rispetto alla versione 2 principalmente grazie al supporto completo di OpenMP (parallelismo dei thread) e grazie a miglioramenti significativi sia nell'usabilità che nelle prestazioni. Abbiamo anche aggiunto di nuovo una serie di nuovi algoritmi dalla letteratura recente, e naturalmente CAMPARI continua a supportare il paradigma del campo di forza ABSINTH e il modello di solvatazione implicita.CAMPARI è un pacchetto congiunto per l'esecuzione e l'analisi di simulazioni molecolari, in particolare di polimeri di rilevanza biologica. Si concentra su un'ampia disponibilità di algoritmi per il campionamento (avanzato) ed è in grado di combinare il campionamento Monte Carlo e la dinamica molecolare senza soluzione di continuità. CAMPARI offre all'utente un altissimo livello di controllo su tutte le funzionalità implementate. Per ulteriori informazioni e funzionalità, fare riferimento alla homepage del progetto all'indirizzo http://campari.sourceforge.net. La versione 2 non viene più mantenuta attivamente, ma la versione finale continua ad essere disponibile.
Caratteristiche
- Campionamento combinato MC e MD, MD nello spazio cartesiano o torsionale / del corpo rigido
- Efficiente parallelizzazione OpenMP di tutte le routine di energia/forza di base
- Analisi al volo o esecuzione come strumento di analisi della traiettoria (anche in parallelo)
- Molte routine di analisi integrate (DSSP, mappe di contatto, funzioni di correlazione di coppia, ecc.)
- Supporto per diversi clustering strutturali e relativi algoritmi insieme alle analisi del modello di stato di Markov
- Completamente documentato (html) e inoltre fornito con 13 tutorial
- Livello di controllo molto elevato (ad es. vincoli olonomi personalizzati in MD)
- Ampio supporto per tecniche di simulazione multi-replica parallela come lo scambio di repliche nell'esecuzione parallela ibrida MPI/OpenMP
- Struttura di analisi autonoma per le strutture del modello statale di clustering/Markov
Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Console/Terminale
Linguaggio di programmazione
Fortran
Questa è un'applicazione che può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/campari/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
