Questa è l'app Linux denominata CoVEC la cui ultima versione può essere scaricata come covec_distribution-v0.4.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata CoVEC con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
CoVEC
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DESCRIZIONE
Il pacchetto fornisce modelli SVM da utilizzare con SVMlight (http://svmlight.joachims.org/) per trarre un consenso dalle previsioni di terze parti individuali sull'effetto delle mutazioni. Gli strumenti di terze parti sono SIFT, Polyphen3, SNPs&GO e Mutation Assessor.
Il pacchetto fornisce anche una serie di moduli e script Perl per assistere nella preparazione dei dati. I moduli possono essere utilizzati per creare strumenti e pipeline personalizzati, mentre gli script forniscono implementazioni eseguibili di base basate sui moduli.
SVMlight, SIFT, Polyphen2, SNPs&GO e Mutation Assessor sono di proprietà dei rispettivi autori e istituzioni e non sono distribuiti in questo pacchetto.
Pubblico
Industria sanitaria, Scienza/Ricerca, Sviluppatori
Interfaccia utente
Console/terminale, riga di comando
Linguaggio di programmazione
Perl
Categorie
Questa è un'applicazione che può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/covec/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.