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Scarica CSBB-v3.0 per Linux

Scarica gratuitamente l'app CSBB-v3.0 per Linux da eseguire online su Ubuntu online, Fedora online o Debian online

Questa è l'app Linux denominata CSBB-v3.0, la cui ultima versione può essere scaricata come CSBB-v3.0.zip. Può essere eseguita online sul provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.

Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata CSBB-v3.0 con OnWorks.

Segui queste istruzioni per eseguire questa app:

- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.

- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.

- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.

- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.

- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.

- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.

CSBB-v3.0


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DESCRIZIONE

CSBB è una suite bioinformatica basata su riga di comando per analizzare dati biologici acquisiti attraverso diverse modalità di esperimenti biologici. CSBB è implementato in Perl, ma sfrutta anche l'uso di R, Java, Python e Ruby in background per moduli specifici. L'obiettivo principale di CSBB è consentire agli utenti della comunità biologica e bioinformatica di trarre vantaggio dall'esecuzione di attività di analisi downstream, eliminando al contempo la necessità di scrivere codice di programmazione. CSBB è attualmente disponibile per Linux e UNIX.

Attualmente CSBB offre 18 moduli focalizzati su attività analitiche come la normalizzazione dei quantili superiori, la visualizzazione interattiva e le pipeline di sequenziamento di nuova generazione. CSBB ora è anche in grado di elaborare dati pubblici. Offre agli utenti un'esperienza completa con le pipeline.

Caratteristiche

  • RNA-Seq
  • Chip-Seq
  • ATAC-Seq
  • Normalizzazione
  • Espressione differenziale
  • Elaborazione dati pubblici
  • Condotte end-to-end
  • Open Source
  • Visualizzazione
  • Bioinformatica


Pubblico

Scienza / Ricerca



Linguaggio di programmazione

Perl



Questa applicazione può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/csbb-v3-0/. È ospitata su OnWorks per poter essere eseguita online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.


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