Questa è l'app Linux denominata CTK, la cui ultima versione può essere scaricata come Version1.1.5sourcecode.tar.gz. Può essere eseguita online sul provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata CTK con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
Ad
CTK
DESCRIZIONE
CTK (CLIP Tool Kit) è un toolkit di biologia computazionale implementato in Perl, progettato per l'analisi dei dati di sequenziamento CLIP. Offre una pipeline semplificata, dalle letture grezze alla chiamata dei picchi e alla scoperta dei motivi.
Caratteristiche
- Analizza le letture CLIP-seq grezze ed esegue il filtraggio della qualità
- Identifica i siti di mutazione indotti dal cross-linking (CIMS)
- Rileva regioni e picchi di motivi di RNA arricchiti
- Emette formati BED/narrowPeak standardizzati
- Estendibile tramite script Perl (ad esempio tag2cluster, tag2collapse)
- Documentazione completa e gruppo di supporto utente attivo
Linguaggio di programmazione
Perl
Categorie
Questa applicazione può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/ctk.mirror/. È ospitata su OnWorks per poter essere eseguita online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
