Questa è l'app Linux denominata CUSHAW2: Parallel Gapped Read Alignment la cui ultima versione può essere scaricata come cushaw2-v2.1.11.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata CUSHAW2: Parallel Gapped Read Alignment con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
CUSHAW2: Allineamento di lettura con gap parallelo
Ad
DESCRIZIONE
CUSHAW2 è un allineamento di lettura gapped veloce e parallelo per genomi di grandi dimensioni, come il genoma umano. La valutazione delle prestazioni, allineando set di dati simulati e reali al genoma umano, mostra che CUSHAW2 è costantemente tra gli allineatori con il punteggio più alto in termini di qualità dell'allineamento sia per l'allineamento single-end che per quello paired-end, dimostrando al contempo una velocità altamente competitiva. Inoltre, il nostro allineatore mostra una buona scalabilità parallela rispetto al numero di thread della CPU.
Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Riga di comando
Linguaggio di programmazione
C++
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/cushaw2/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
