Questa è l'app Linux denominata denovo_solid_pipeline, la cui ultima versione può essere scaricata come denovo_solid_pipeline_1.0.1.tar.gz. Può essere eseguita online sul provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata denovo_solid_pipeline con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
denovo_solid_pipeline
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DESCRIZIONE
denovo_solid_pipeline (DSP) è una pipeline semi-automatica per l'assemblaggio di genomi corti utilizzando dati di sequenziamento SOLiD. Le caratteristiche principali della pipeline sono l'ottimizzazione del numero di esecuzioni di lettura-correzione e delle risorse computazionali tramite programmazione dinamica. DSP ha anche il vantaggio, rispetto alla pipeline attualmente disponibile (denovo2), di generare più contig adatti per ulteriori fasi di assemblaggio, aumentando le possibilità di rilevare errori di sequenziamento e/o siti polimorfici.
Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Console/Terminale
Linguaggio di programmazione
Shell Unix
Categorie
Questa applicazione può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/denovosolid/. È ospitata su OnWorks per poter essere eseguita online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
