Questa è l'app Linux denominata Hamstr la cui ultima versione può essere scaricata come hamstr.v13.2.6-bin-lib.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app chiamata Hamstr con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
Hamstr
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DESCRIZIONE
HaMStR si è trasferito a https://github.com/bionf/hamstr dove ora fa parte del pacchetto HaMStR-OneSeq.
HaMStR è uno strumento basato su un modello Markov nascosto di profilo per una ricerca ortologa diretta nei dati di sequenza proteica o EST. Il programma prende un gruppo predefinito di sequenze ortologhe (core orthologs) e un insieme di sequenze da un taxon di ricerca come input. HaMStR combina quindi in una strategia in due fasi una ricerca basata su pHMM e una ricerca inversa tramite BLAST per estendere il gruppo ortologo principale con nuove sequenze dal taxon di ricerca.
Pubblico
Scienza / Ricerca
Linguaggio di programmazione
Perl
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/hamstr/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
