Questa è l'app Linux denominata High-Throughput Tabular Data Processor la cui ultima versione può essere scaricata come htdpinstaller.exe. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata Processore di dati tabulari ad alta produttività con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
Ad
Processore di dati tabulari ad alta produttività
DESCRIZIONE
IL PROCESSORE DI DATI TABULARE AD ALTO PROCESSO (HTDP) è un'applicazione Java che ha lo scopo di facilitare l'esplorazione dei dati e le attività di riduzione in file di testo di grandi dimensioni derivanti da tecnologie ad alto rendimento, ad esempio sequenziamento parallelo massivo o microarray. Il software è stato ottimizzato per microarray e dati di sequenziamento parallelo profondo, tuttavia può accettare qualsiasi set di dati tabulari delimitati da caratteri. HTDP può anche importare, elaborare e convertire file Variant Call Format (VCF) ver. 4.0, 4.1 e 4.2 (http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).
HTDP fornisce funzionalità di filtraggio rapido e può elaborare dati costituiti da file di input singoli o multipli.
Citazione: Madanecki P, Bałut M, Buckley PG, Ochocka JR, Bartoszewski R, Crossman DK, et al. (2018) Processore di dati tabulare ad alta produttività: strumento grafico indipendente dalla piattaforma per l'elaborazione di grandi insiemi di dati. PLoS UNO 13(2): e0192858. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
Caratteristiche
- funziona su qualsiasi dato di colonna delimitato da caratteri (ad esempio BED, GFF, GTF, WIG, VCF)
- unire file di dati tabulari verticalmente e orizzontalmente
- unire qualsiasi file di dati tabulari utilizzando la posizione del genoma o colonne comuni
- capacità illimitate di filtraggio e riduzione dei dati
- file diversi per quanto riguarda formato e contenuto possono essere analizzati contemporaneamente
Linguaggio di programmazione
Java
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/htdp/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
