Questa è l'app Linux chiamata MAF, la cui ultima versione può essere scaricata come MAF.zip. Può essere eseguita online sul provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata MAF con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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MAF
DESCRIZIONE
Le sequenze nucleotidiche di DNA e RNA sono un elemento onnipresente in tutte le cellule biologiche e fungono da un lato da una libreria completa di funzionalità per le cellule e dall'altro da un potente sistema di regolazione per il controllo delle funzioni cellulari. Il framework di multi-allineamento (MAF) presentato dovrebbe fornire ai ricercatori una piattaforma di allineamento di sequenze semplice da utilizzare come modello funzionale, sufficientemente flessibile da adattare tutte le fasi ma anche sufficientemente completa da integrare diversi strumenti e combinazioni di parametri personalizzati qualora sia necessaria o consigliata un'analisi approfondita, ad esempio in situazioni di bassa velocità di lettura. La piattaforma consente ai ricercatori di applicare più allineatori e ulteriori strumenti di elaborazione in combinazioni flessibili per analizzare le differenze, da sottili a notevoli, tra diversi programmi di allineamento e algoritmi applicati alla stessa base di dati.
Caratteristiche
- Applicazione congiunta di diversi strumenti di allineamento esemplificati dagli script bash
- Fasi di pre e post-elaborazione flessibili, estensibili e completamente riprogettabili
- Modelli Bash che fanno risparmiare tempo di sviluppo
Questa applicazione può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/multialignmentframework/. È ospitata su OnWorks per poter essere eseguita online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
