Questa è l'app Linux denominata MSP-HTPrimer la cui ultima versione può essere scaricata come msp-htprimer-cgi.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata MSP-HTPrimer con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
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MSP-HT Primer
DESCRIZIONE
MSP-HTPrimer è una pipeline di progettazione di primer open source, basata sul web e ad alto rendimento per l'intero genoma per saggi basati su bisolfito (MSP, BSP e COBRA) e saggi MSRE-PCR e in grado di elaborare contemporaneamente da centinaia a migliaia di sequenze target. MSP-HTPrimer prende in considerazione le annotazioni a livello di genoma degli SNP e le ripete per progettare coppie di primer per una maggiore percentuale di successo. MSP-HTPrimer consente il filtraggio gerarchico e la visualizzazione dei primer progettati nel browser del genoma UCSC per una selezione efficiente dei saggi.Caratteristiche
- BSP
- MSP
- metilazione del DNA
- BSP COBRA
- MSRE
Questa è un'applicazione che può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/msp-htprimer/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
