Questa è l'app Linux denominata PPIXpress la cui ultima versione può essere scaricata come PPIXpress_1.23.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app chiamata PPIXpress con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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PPIXpress
DESCRIZIONE
Sebbene le reti di interazione proteina-proteina siano una componente onnipresente della moderna biologia dei sistemi, sono stati fatti relativamente pochi sforzi per adattare la loro topologia all'effettiva condizione cellulare oggetto di studio. Poiché una semplice riduzione delle reti al sottoinsieme dei geni espressi graffia solo la superficie delle capacità regolatorie degli organismi superiori, proponiamo il metodo avanzato PPIXpress che consente di sfruttare i dati di espressione a livello di trascritto ed è quindi in grado di rivelare anche alterazioni in connettività proteica causata da splicing alternativo.
La pubblicazione originale si trova su https://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/32/4/571 .
Caratteristiche
- costruzione automatica di reti di interazione proteina-proteina
Pubblico
Industria sanitaria, Scienza/Ricerca
Interfaccia utente
Java Swing, Console/Terminale, Riga di comando
Linguaggio di programmazione
Java
Categorie
Questa è un'applicazione che può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/ppixpress/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.