Questa è l'app Linux denominata PSOVina 2.0, la cui ultima versione può essere scaricata come POSE_PREDICTION.tar.gz. Può essere eseguita online sul provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata PSOVina 2.0 con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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PSOVina 2.0
DESCRIZIONE
Uno strumento di docking rapido basato sull'efficiente algoritmo di ottimizzazione di Particle Swarm Intelligence e sul framework di AutoDock Vina. Basato sull'implementazione iniziale di PSO, il nostro metodo PSOVina ha subito diversi importanti miglioramenti per aumentare la precisione di docking e raggiungere un'efficienza notevole rispetto all'originale AutoDock Vina.Caratteristiche
- Molto più veloce di AutoDock Vina con una precisione migliore o simile
- Adatto per l'attracco proteina-ligando e lo screening virtuale
- L'ultima versione PSOVina-2.0 incorpora la funzione caotica di Singer nella ricerca globale e un metodo efficiente a 2 fasi nella ricerca locale
- Ottieni una velocità 6-7 volte superiore a quella di Vina
Questa applicazione può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/psovina/. È ospitata su OnWorks per poter essere eseguita online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
