Questa è l'app Linux denominata PSOVina 2.0 la cui ultima versione può essere scaricata come POSE_PREDICTION.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app chiamata PSOVina 2.0 con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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PSOVina 2.0
DESCRIZIONE
Uno strumento di aggancio rapido basato sull'algoritmo di ottimizzazione efficiente di Particle Swarm Intelligence e sul framework di AutoDock Vina. Basato sull'implementazione iniziale di PSO, il nostro metodo PSOVina ha subito diversi importanti miglioramenti per migliorare l'accurato di docking e ottenere una notevole efficienza rispetto all'AutoDock Vina originale.Caratteristiche
- Molto più veloce di AutoDock Vina con una precisione migliore o simile
- Adatto per il docking proteina-ligando e lo screening virtuale
- L'ultima versione PSOVina-2.0 incorpora la funzione caotica di Singer nella ricerca globale e un metodo efficiente in 2 fasi nella ricerca locale
- Ottieni una velocità 6-7 volte superiore rispetto a Vina
Questa è un'applicazione che può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/psovina/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
