Si tratta dell'app Linux denominata RUbioSeq, la cui ultima versione può essere scaricata come RUbioSeq3.8.1.tgz. Può essere eseguita online sul provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app chiamata RUbioSeq con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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RUbioSeq
DESCRIZIONE
La crescente domanda di studi di sequenziamento di nuova generazione (NGS) ha evidenziato la necessità di pipeline integrate e affidabili per analizzare gli esperimenti di deep-sequencing in modo efficiente. Presentiamo RUbioSeq+, un'applicazione stand-alone e multipiattaforma per l'analisi integrata di dati NGS. Più specificamente, il nostro software implementa pipeline per l'analisi di esperimenti di variazione di singolo nucleotide e del numero di copie, bisolfito-seq e ChIP-seq, utilizzando strumenti consolidati per eseguire queste attività comuni. RUbioSeq+ è gratuito e include tutte le funzionalità principali implementate nella versione originale di RUbioSeq (v3.2.1), ma, al contempo, supera e amplia le capacità di RUbioSeq supportando l'analisi parallelizzata di genomi completi in ambienti di calcolo. RUbioSeq+ incorpora anche una nuova interfaccia utente grafica progettata per gruppi di ricerca interdisciplinari in cui bioinformatici e ricercatori biomedici lavorano insieme.
Linguaggio di programmazione
Perl
Categorie
Questa applicazione può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/rubioseq/. È ospitata su OnWorks per poter essere eseguita online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
