Questa è l'app Linux denominata SASHIMI la cui ultima versione può essere scaricata come TPP_Setup_6.3.3.exe. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata SASHIMI con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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SASHIMIA
DESCRIZIONE
Il progetto Sashimi ospita la Trans-Proteomic Pipeline (TPP), una suite matura di strumenti per la proteomica basata su spec di massa (MS, MS/MS): convalida statistica, quantificazione, visualizzazione e convertitori dai dati MS grezzi al mzML/ aperto formati mzXML.
Caratteristiche
- Motori di ricerca in database (cometa ecc.)
- SpecraST (motore di ricerca della libreria di spettro)
- Ricerca di massa aperta (Magnum ecc.)
- Kojak (ricerca di collegamenti incrociati)
- Analisi DDA
- DISCo (Analisi DIA)
- rispetto (analisi dello spettro chimerico)
- Quantificazione MS1 e MS2 con e senza etichetta
- Generazione di database esca
- PeptideProphet (convalida livello PSM)
- iProphet (convalida del livello di peptide)
- PTMProphet (convalida della modifica post-traduzionale)
- Convalida del livello di proteine
- Generazione di librerie di spettro
- Strumenti di visualizzazione dei dati
- Catalogazione e previsione del tempo di conservazione
Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Basato sul Web, riga di comando
Linguaggio di programmazione
Python, Perl, C++, C, JavaScript, Java
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/sashimi/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri Sistemi Operativi gratuiti.