Questa è l'app Linux chiamata Seal la cui ultima versione può essere scaricata come seal-0.4.0-rc2.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app chiamata Seal con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
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DESCRIZIONE
Seal è un toolkit di analisi e allineamento di lettura breve distribuito basato su Hadoop. Attualmente Seal include strumenti per: demultiplexing di lettura, allineamento di lettura, rimozione di letture duplicate, ordinamento di mappature di lettura e calcolo di statistiche per la ricalibrazione empirica della qualità di base. Sigilla le bilance, gestendo facilmente TB di dati.Caratteristiche
- allineamento di lettura breve (basato su BWA)
- identificazione di lettura duplicata
- ordina le mappature di lettura
- calcolare tabelle empiriche di ricalibrazione della qualità di base
- veloce, scalabile, affidabile (gira su Hadoop)
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/biodoop-seal/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
