Questa è l'app Linux denominata The Protein Similarity Network la cui ultima versione può essere scaricata come PSIN_0.0.2.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata The Protein Similarity Network con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
La rete di somiglianza proteica
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DESCRIZIONE
Questa è la rete di similarità proteica - PSIN. Qui, i nodi sono proteine umane e sono collegati solo se condividono una notevole somiglianza di sequenza.
Abbiamo scoperto che questa rete è particolarmente utile per distinguere i target farmacologici approvati da quelli problematici.
Qui trovi anche il set completo di programmi e set di dati che abbiamo utilizzato per questo scopo.
Liberi di aiutare ulteriormente a testare e sviluppare questo progetto. Il tuo aiuto e la tua competenza sono molto apprezzati!
In caso di domande, non esitate a contattarci nel forum o via e-mail.
Si prega di consultare il manoscritto originale:
Lopes, TJS, et al. (2015) - "Identificazione dei farmaci problematici in base alle caratteristiche dei loro bersagli" - Frontiers in Pharmacology doi: 10.3389/fphar.2015.00186
Pubblico
Settore sanitario, scienza/ricerca, utenti finali avanzati
Linguaggio di programmazione
Perl, Java, S/R
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/psin/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.