Questa è l'app Linux denominata VIGOR3, da eseguire online su Linux. La sua ultima versione può essere scaricata come VIGOR3.tgz. Può essere eseguita online sul provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata VIGOR3 per eseguirla gratuitamente su Linux online con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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VIGOR3 funzionerà online su Linux
DESCRIZIONE
VIGOR è uno strumento per annotare i geni codificanti nei genomi virali. È stato sviluppato da Jeffrey Hoover e Shiliang Wang per il JCVI Genomic Sequencing Center for Infectious Diseases (GSCID).http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1471-2105-11-451.pdf
contattare:
Jeff Hoover
301-540-7858
[email protected]
Caratteristiche
- comprende l'editing dell'RNA, lo slittamento ribosomiale, il read-thru del codone di stop e i codoni di inizio alternativi
- annota i peptidi maturi sulle poliproteine
- gestisce i geni uniti, sovrapposti e incorporati
- gestisce genomi circolari, parziali e draft (gapped)
- diagnostica i frameshift nell'assemblaggio
- include set di dati di riferimento per più di 50 specie
- include strumenti per la creazione di nuovi set di dati di riferimento
Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Riga di comando
Linguaggio di programmazione
Perl
Ambiente database
SQLite
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/vigor3/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
