Questa è l'app Windows denominata FastQC la cui ultima versione può essere scaricata come v0.12.1sourcecode.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata FastQC con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avvia qualsiasi emulatore online OS OnWorks da questo sito Web, ma migliore emulatore online Windows.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Windows che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione e installala.
- 7. Scarica Wine dai repository software delle tue distribuzioni Linux. Una volta installato, puoi quindi fare doppio clic sull'app per eseguirli con Wine. Puoi anche provare PlayOnLinux, un'interfaccia fantasiosa su Wine che ti aiuterà a installare programmi e giochi Windows popolari.
Wine è un modo per eseguire il software Windows su Linux, ma senza Windows richiesto. Wine è un livello di compatibilità Windows open source in grado di eseguire programmi Windows direttamente su qualsiasi desktop Linux. Essenzialmente, Wine sta cercando di re-implementare abbastanza Windows da zero in modo che possa eseguire tutte quelle applicazioni Windows senza effettivamente bisogno di Windows.
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Controllo di qualità veloce
DESCRIZIONE
FastQC è uno strumento di analisi del controllo qualità progettato per individuare potenziali problemi nei set di dati di sequenziamento ad alto rendimento. Il suo obiettivo è fornire un modo semplice per controllare la qualità dei dati di sequenza grezzi provenienti da pipeline di sequenziamento ad alto throughput. Lo fa eseguendo un insieme modulare di analisi su uno o più file di sequenze grezze in formato fastq o bam. Quindi produce un rapporto che riassume i risultati ed evidenzia eventuali aree in cui la libreria potrebbe apparire insolita. Questo dovrebbe quindi indirizzarti dove i tuoi dati potrebbero avere problemi e consentirti di adottare le misure necessarie per correggerli prima di eseguire ulteriori analisi.
FastQC non è legato a nessun tipo specifico di tecnica di sequenziamento, quindi può essere utilizzato per esaminare librerie di vari tipi di esperimenti (Sequenziamento genomico, ChIP-Seq, RNA-Seq, BS-Seq ecc ecc).
Caratteristiche
- Importa dati da file BAM, SAM o FastQ
- Offre una rapida panoramica che evidenzia potenziali aree problematiche
- Grafici e tabelle riepilogative per una rapida valutazione dei dati
- Esporta i risultati in HTML
- Può essere utilizzato offline
Linguaggio di programmazione
Java
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/fastqc.mirror/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri Sistemi Operativi gratuiti.
