Questa è l'app di Windows denominata Javamony da eseguire in Windows online su Linux online la cui ultima versione può essere scaricata come Javamony.jar. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata Javamony per l'esecuzione in Windows online su Linux online con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avvia qualsiasi emulatore online OS OnWorks da questo sito Web, ma migliore emulatore online Windows.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Windows che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione e installala.
- 7. Scarica Wine dai repository software delle tue distribuzioni Linux. Una volta installato, puoi quindi fare doppio clic sull'app per eseguirli con Wine. Puoi anche provare PlayOnLinux, un'interfaccia fantasiosa su Wine che ti aiuterà a installare programmi e giochi Windows popolari.
Wine è un modo per eseguire il software Windows su Linux, ma senza Windows richiesto. Wine è un livello di compatibilità Windows open source in grado di eseguire programmi Windows direttamente su qualsiasi desktop Linux. Essenzialmente, Wine sta cercando di re-implementare abbastanza Windows da zero in modo che possa eseguire tutte quelle applicazioni Windows senza effettivamente bisogno di Windows.
IMMAGINI
Ad
Javamony per l'esecuzione in Windows online su Linux online
DESCRIZIONE
Basato sul non così riuscito Pysimony (https://sourceforge.net/projects/pysimony/), lo stesso studente risoluto riprende il problema filogenetico.Javamony viene invocato come segue:
java -jar Javamony.jar [input.fasta] [random / stepwise (albero iniziale)] [n. di bootstrap] [taxon outgroup n. 1] [taxon outgroup n. 2] ...
Non inteso come un programma di inferenza filogenetica competitivo, Javamony è un'opportunità per me di acquisire il linguaggio Java mentre imparo ad affrontare e risolvere problemi fondamentali in filogenetica. Pertanto, per il mio beneficio educativo, tutto il codice è originale. Ovviamente ci sono anche molti errori.
Distribuisco Javamony, come ho fatto Pysimony, sperando che sia di valore educativo per qualcun altro o almeno vagamente divertente.
Le prossime funzionalità saranno:
- Supporto per sequenze di aminoacidi
- Supporto per formati di file aggiuntivi (es. Nexus)
- Multithreading
- Metodi di punteggio aggiuntivi (es. massima verosimiglianza)
Caratteristiche
- Usa la massima parsimonia
- Legge un file di input FASTA (solo DNA)
- Outgroup stabilito dall'utente
- Alberi di partenza con addizione casuale e graduale
- Utilizza la ricerca di alberi SPR (potatura e reinnesto del sottoalbero)
- Esegue il bootstrap
- Emette il formato Newick standard con supporto bootstrap e lunghezze dei rami
- Disegna l'albero finale con il supporto bootstrap
Pubblico
Scienza/Ricerca, Istruzione
Interfaccia utente
Riga di comando
Linguaggio di programmazione
Java
Questa è un'applicazione che può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/javamony/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
