Questa è l'app Windows denominata UniPyRange per l'esecuzione in Windows online su Linux online la cui ultima versione può essere scaricata come UniPyRangeSuite.py. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata UniPyRange per l'esecuzione in Windows online su Linux online con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avvia qualsiasi emulatore online OS OnWorks da questo sito Web, ma migliore emulatore online Windows.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Windows che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione e installala.
- 7. Scarica Wine dai repository software delle tue distribuzioni Linux. Una volta installato, puoi quindi fare doppio clic sull'app per eseguirli con Wine. Puoi anche provare PlayOnLinux, un'interfaccia fantasiosa su Wine che ti aiuterà a installare programmi e giochi Windows popolari.
Wine è un modo per eseguire il software Windows su Linux, ma senza Windows richiesto. Wine è un livello di compatibilità Windows open source in grado di eseguire programmi Windows direttamente su qualsiasi desktop Linux. Essenzialmente, Wine sta cercando di re-implementare abbastanza Windows da zero in modo che possa eseguire tutte quelle applicazioni Windows senza effettivamente bisogno di Windows.
IMMAGINI
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UniPyRange per funzionare in Windows online su Linux online
DESCRIZIONE
Script Python molto semplice che ti risparmia la fatica di contare gli amminoacidi/basi del DNA nei file fasta dal database Uniprot e NCBI RefSeq (1, 2).Supponiamo che tu voglia la sequenza di amminoacidi dell'intervallo 128-387 da una proteina di 1000 amminoacidi: questo script ti aiuterà a evitare errori di conteggio semplicemente mostrandoti la sequenza specificata negli amminoacidi e codificando le coppie di basi del DNA (ideale per la progettazione di primer di amplificazione ) di un ID Uniprot specificato.
- Richiede BioPython (3) e Pacchetto Bioservizi (4)
(1)
Il Consorzio UniProt
UniProt: un hub per le informazioni sulle proteine
Acidi nucleici Res. 43: D204-D212 (2015).
(2)
RefSeq: un aggiornamento sulle sequenze di riferimento dei mammiferi. Acidi nucleici Res. 2014 gennaio 1;42(1):D756-63.
(3)
Gallo PJ et al. Bioinformatica (2009)
(4)
Cokelaer et al, Bioinformatica (2013)
Linguaggio di programmazione
Python
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/unipyrange/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.